FAST-ATLAS Pour un suivi des simulations couplées et un usage simplifié de Ferret  Patrick Brockmann Dernière mise à jour :  26/09/2007

Objectif
Choix techniques
Veilles technologiques
Réalisations
Exemple d'utilisation
Fiches de formation
FAQ
Présentations
Atelier
Utilisateurs

• Mettre en place un outils d'analyse et de visualisation pour les
  sorties des modèles couplés de l'IPSL (Atmosphère, Océan, Glace de Mer,
  Végétation, Chimie, ...). Les contraintes principales sont d'avoir un outils distribuable
  libre de droit et de travailler avec une architecture de distribution de données basée
  sur OPeNDAP/DODS.
  Les sorties des modèles couplés sont accessibles soit en local soit à partir de
  serveurs OPeNDAP/DODS et l'on souhaite pouvoir réaliser des atlas de contrôle ou
  des analyses sur ces fichiers sans avoir à les rapatrier ou effectuer des extractions.
  La génération de ces atlas doit pouvoir se réaliser après production des fichiers ou au
  cours même des simulations de manière automatique et automone.

• Ferret repond bien aux critères fixés puisqu'il est distribué librement
  
et qu'il est un client OPeNDAP/DODS. D'autre avantage, l'équipe de développement du PMEL
est aussi impliqué dans le développement du protocole OPeNDAP/DODS.
Les scripts Ferret mis en place concernent la visualisation mais pas l'assemblage des pages produites,
ni la répétition des scripts. La génération automatique de documents a donc nécessité la réalisation
préalable de programmes en shell pour mettre en place l'automatisation
des scripts Ferret et l'assemblage des documents produits.
 
• Ksh, Csh sont des languages de scripts portables surtout sur supercalculateurs.
  
Ils ont donc été utilisé de préference, avec même une préférence affichée pour le Ksh
(voir le lien "Why shouldn't I program in csh?").
 
• gs, convert, pnmfile, pnmcrop, pnmflip
  Ces outils ont été utilisés dans des programmes shell pour réaliser différentes
  conversions entre format postscript, format GIF, format PDF.
  
  
• pdflatex et pdfpages
  
Le package pdfpages permet de combiner plusieurs documents pdf en un document
unique. Beaucoup d'options sont disponibles quant à l'arrangement des pages.
Ce package est disponible à travers la distribution de teTeX, distribution de TeX.
Voir au besoin la note d'installation suivante.


• Le format Flash
  Le format Flash est un format d'animation vectorielle très répandu. Des boutons de contrôles
  peuvent être ajoutés directement dans l'animation et lu à travers un navigateur ou encore inclus
  dans un fichier de présentation.

• Ferret. Les bugs que je repère sont envoyés à l'équipe du PMEL et décrits à partir
  de la page suivante : http://dods.ipsl.jussieu.fr/brocksce/ferret_bugs/
  
  
• Python et le package CDAT associés à NumPy (Numerical Python).
  
  
• Le protocole de transfert de données OPeNDAP/DODS.
  

• La convention CF (Climate and Forecast) pour la gestion des métadata du format netCDF.
  
  
• Les opérateurs NCO (netCDF Operators) pour effectuer des calculs ou  modifier les
  contenus des fichiers netCDF.
  
  
• Les formats PNG et MNG et les outils associés afin de trouver une alternative à l'usage
  
du format GIF.


• La bibliothèque VTK pour réaliser des applications de visualisation 2D/3D.
  

• Développement d'une bibliothèque de scripts Ferret appelée
  
FAST (Ferret Analysis Scripting Toolbox) permettant de réaliser
différentes projections à partir de sorties de modèles à grilles complexes.
Possibilités de visualisation de champs de vecteurs non structurés et faciltés
pour la mise en page.
 
• Réalisation d'un script shell appelé ferretloop permettant de palier au fait que Ferret
  
n'est pas un langage de script et ne peut donc pas réaliser de boucles sur une liste de
fichiers. Ce script constitue un point clé pour la réalisation d'atlas puisqu'il permet d'automatiser
une production de documents à partir d'une liste de fichiers netCDF. Le répertoire crée au final
contient les images gif produites et si spécifié un document pdf multipages.
Voir l'aide en ligne : ferreloop -h
 
• Réalisation d'un script shell appelé atlas permettant d'automatiser la production
  
d'atlas en regroupant sous forme de fichier de configuration des appels à ferretloop.
Au final, le repertoire créé contient les différents répertoires générés par les appels
successifs à ferretloop,  un index hypertext pointant sur les différents fichiers gif et pdf produits,
ainsi qu'un document pdf unique à onglets regroupant tous les fichiers pdf produits.
Ce script appelle pdf2pdf et indexhtml décrits ci-dessous.
Voir l'aide en ligne : atlas -h
 
• Réalisation d'un script shell appelé ps2pdf permettant de convertir un ou plusieurs
  fichiers du format postscript au format PDF.
  Voir l'aide en ligne : ps2pdf -h
  
  
• Réalisation d'un script shell appelé ps2gif permettant de convertir un fichier du
  format postscript au format GIF en respectant des rapports de taille de page A4 (portrait ou landscape).
  Voir l'aide en ligne : ps2gif -h
  

• Réalisation d'un script shell appelé pdf2pdf permettant de regrouper les documents
  
pdf indiqués en entrée sous forme d'un document pdf unique à onglets.
Voir l'aide en ligne : pdf2pdf -h
 
• Réalisation d'un script shell appelé indexhtml permettant de générer un index hypertext
  
pointant vers les documents indiqués en entrée.
Voir l'aide en ligne : indexhtml -h
 
• Le schéma suivant illustre l'architecture des scripts mis en place :
  
  
  

• Fiche 00 : FAST Installation Guide
  
• Fiche 01 : Guide d'installation du package ATLAS 
• Fiche 02 : Utilisation de FAST-ATLAS au LSCE, à l'IDRIS et au CCC 
• Fiche 03 : Premiers pas
  
• Fiche 04 : Etre efficace  ...
• Fiche 05 : Mise en page, légendes et annotations ...
  
• Fiche 06 : Mode d'utilisation de Ferret  ...
• Fiche 07 : Regridding, calcul d'une différence entre 2 variables   ...
• Fiche 08 : Passage de niveaux sigma en niveaux de pression pour LMDZ3.3  ...
• Fiche 09 : Projections ...
• Fiche 10 : Regridding, changement d'échelle temporel  ...
• Fiche 11 : Réalisation d'une animation ...
• Fiche 12 : Automatisation, scripts ferretloop et atlas ...
  
  Ces fiches ont été crées avec Mozilla en mode composition et en utilisant des feuilles de style
  "Cascading Style Sheet" (CSS) personelles. Cela me permet de modifier l'ensemble du style des fiches de
  manière aisée et également de contrôler le style des pages html lors d'une impression.
  Voir la Fiche modèle. Voir les feuilles de style.
  

• Où sont centralisées les climatologies utilisées pour les atlas ?
• Comment récupérer le matériel (scripts et fichiers de configuration) utilisé pour réaliser les atlas ?
• Comment définir des niveaux lorsqu'on visualise une variable avec Ferret ?
• Comment envoyer un job depuis Rhodes ?
• Comment programmer un job nocturne sur Rhodes ?
• Comment envoyer un job depuis Mercure ?
• Comment bien utiliser ferret et des serveurs DODS ?
• Comment obtenir de l'aide sur les scripts ferret disponibles dans le package FAST ?
• Comment découvrir les différentes palettes de couleurs disponibles dans le package FAST ?
• Comment récuperer un fond de carte ?
• Comment convertir du PDF en EPS ?
• Quel est l'espace nécessaire pour les programmes ferretloop, atlas, pdf2pdf, plt2pdf ?
• Comment configurer Netscape pour ouvrir directement des fichiers pdf ?
• Comment configurer Netscape pour ouvrir les fichiers gif directement avec xanim ?
• Comment contrôler le défilement d'une animation gif avec xanim ?
• Quelles sont les alternatives à l'usage du programme xanim ?
• Comment faire un peu de ménage automatiquement dans mes répertoires ?
• Comment utiliser pdf2pdf et où trouver la documentation sur le package pdfpages ?
• Comment utiliser index2html ?
• Pourquoi avoir utiliser le format PDF ?
• Pourquoi avoir utiliser le format GIF ?
• Comment créer une séquence animée au format GIF à partir d'images GIF ?
• Comment créer une séquence animée au format AVI à partir d'images GIF ?
• Comment créer une séquence animée au format SWF à partir d'images GIF ?
• Comment déposer diffuser vos résultats avec les serveur WEB/DODS de l'IPSL ?
• Comment combiner des fichiers de configuration ligne à ligne ?
• Comment rajouter des pages d'entête à un atlas au format pdf ?

• Où sont centralisées les climatologies utilisées pour les atlas ?
Vous pouvez les trouver sur le serveur DODS de l'IPSL.
http://dods.ipsl.jussieu.fr/cgi-bin/nph-dods/database/
Vous pourrez trouver des informations sur ces climatologies à partir
de la page suivante.
Vous pouvez récupérer la totalite de ces fichiers de référence en tapant la commande :
wget -r --no-parent -nH --cut-dirs=1 -A.nc  http://dods.ipsl.jussieu.fr/database/climato/

• Comment récupérer le matériel (scripts et fichiers de configuration) utilisé pour réaliser les atlas ?
Utiliser les commandes cvs suivantes :
cvs -d :pserver:anonymous@cvs.ipsl.jussieu.fr:/home/ioipsl/CVSROOT login
type anonymous
cvs -d :pserver:anonymous@cvs.ipsl.jussieu.fr:/home/ioipsl/CVSROOT export -r ATLAS_600_1_0 atlas
Vous pouvez explorer le lien suivant pour découvrir le contenu de ce dépot via ViewVC.

• Comment définir des niveaux lorsqu'on visualise une variable avec Ferret ?
Cette question concerne l'usage du qualifier /levels décrit dans la documentation
de Ferret (http://ferret.wrc.noaa.gov/Ferret/Documentation/).
Quelques exemples :
/lev=(-140,20,20) usage classique de -140 à 20 par pas de 20
/lev=(-1E+4)(-140,20,20)(1E+4) idem que ci-dessus mais permet une saturation
/lev=(-1E+4)(1,5,1)(8,14,2)(1E+4) usage de 2 définitions (lo, hi, delta) imbriquées ou non
/lev=(-1E+4)(0,90,10)(1E+4)DEL(50) retrait du niveau 50
/lev=(-1E+4)(-60,60,20)(-10,10)(1E+4) définition supplémentaire des niveaux symétriques -10 et 10
/lev=(-1E+4)(6,26,4)(24)(27)(28)(1E+4) définition supplémentaire des niveaux 24, 25 et 28
Attention à bien spécifier des valeurs de saturation en accord avec les niveaux
indiqués. Ainsi, il est nécessaire d'utiliser /lev=(-1E+1)(-0.4,0.2,0.02)(1E+1)
plutôt que /lev=(-1E+4)(-0.4,0.2,0.02)(1E+4) afin que la barre de couleurs/niveaux
soit bien définie par Ferret. Noter l'utilisation de (-1E+1) au lieu de (-1E+4).

Une alternative à l'utilisation de valeurs de saturation dans le qualifier /levels est l'usage
des fonctions min et max. Ainsi, il est possible de spécifier une grandeur saturée comme suit :
yes? fill/levels=(0.,20.,5.) max(min(variable, 15.), 0.)

A partir de la version 5.81 de Ferret, il devient possible de spécifier des valeurs de
saturation du type (-INF) et (INF). Pour l'instant, uniquement sur machines du LSCE.

• Comment envoyer un job depuis Rhodes ?
Utiliser le modèle de job donné par le fichier job_rhodes_template.
C'est un job complétement autonome;  aucune installation et
aucun positionnements ni de variables ni d'écran ne sont requis.
Vous serez prévénu par email de la fin du job. Les résultats sont
stockés sur la machine d'archivage Gaya et accessibles depuis
Rhodes via la variable $HOMEGAYA mais ces résultats sont aussi
directement accessible via le serveur DODS de l'IDRIS (http://dods.idris.fr)
Pour le soumettre depuis Rhodes, taper :
qsub nomdujob
Pour obtenir l'état de vos soumissions depuis Rhodes, taper :
qstat -a et qcat jobid
N'oubliez pas de positionner dans le fichier $HOME/.forward
une adresse email valide et de recopier le fichier .ferret dans
votre $HOME en tapant : cp $FER_FAST/.ferret ~

• Comment programmer un job nocturne sur Rhodes ?
Attention, il y a une limite de temps CPU en seconde qui est de 3600s dans la journée et de 7200s
pour les jobs lancés en nocturne. Pour décaler la soumission d'un job, utiliser la commande at.
Pour décaler par exemple la soumission d'un job de 4 heures, vous utiliserez la commande :
at + now 4 hours
qsub job1
^D
Les informations concernant la machine Rhodes et l'environnement informatique
de l'IDRIS sont disponibles sur http://www.idris.fr

• Comment envoyer un job depuis Mercure ?
Utiliser le modèle de job donné par le fichier job_mercure_template.
C'est un job complétement autonome;  aucune installation et
aucun positionnements ni de variables ni d'écran ne sont requis.
Vous serez prévénu par email de la fin du job. Les résultats sont
stockés sur la machine d'archivage Fer et accessibles depuis
Mercure via la variable $SCRATCHDIR.
Pour le soumettre depuis Mecure, taper :

qsub nomdujob
Pour obtenir l'état de vos soumissions depuis Mercure, taper :
qstat et qcat jobid ou qcat -f jobid pour une consultation en continu.
Les informations concernant la machine Mercure sont disponibles
en tapant : mercure.info
N'oubliez pas de positionner dans le fichier $HOME/.forward
une adresse email valide et de recopier le fichier .ferret dans
votre $HOME en tapant : cp $FER_FAST/.ferret ~

• Comment bien utiliser ferret et des serveurs DODS ?
Je préconise vivement de rendre inactif le cache local DODS crée par ferret.
En effet, j'ai pu constater plusieurs bugs relatifs à son usage notamment sur
le dépassement de la taille maximale du cache autorisé.
Pour cela, faire un rm -rf ~/.dods_cache et changer dans le fichier .dodsrc

USE_CACHE=1 en USE_CACHE=0.

Si vous souhaitez néanmoins utiliser le cache DODS,
vous pourrez trouver de l'information sur sa configuration
à partir du serveur d'UNIDATA en suivant le lien suivant :
        The DODS Client Initialization File (.dodsrc)
http://www.unidata.ucar.edu/packages/dods/user/guide-html/guide_72.html

• Comment obtenir de l'aide sur les scripts ferret disponibles dans le package FAST ?
Vous êtes perdu dans l'usage des scripts proposés dans FAST, taper dans une session
ferret go/h script ou bien encore taper fast qui est un alias pour obtenir la liste des fichiers
de la distribution. Attention, vous devrez avoir recopier auparavant le fichier .ferret dans votre
répertoire HOME avec la commande cp $FER_FAST/.ferret ~

• Comment découvrir les différentes palettes de couleurs disponibles dans le package FAST ?
Pour choisir, la palette adéquate, vous pouvez utiliser :
xanim $FER_FAST/colors_demo.gif (voir l'animation) ou
bien encore regarder l'animation au format flash (voir l'animation flash).
et jeter un oeil sur les scripts colors_xv2ferret et reverse_filespk qui permettent
de récupérer des couleurs depuis une image et également d'inverser une palette
de couleurs.

• Comment récuperer un fond de carte ?
Jeter un oeil au serveur suivant http://crusty.er.usgs.gov/coast/getcoast.html
et procéder comme suit :

• Sur le serveur de l'USGS :
1. Selectionner la base de données souhaitée
   
(attention à limiter la séléction pour les échelles les plus petites)
2. Selectionner Mapgen pour "Coast Format Options"
3. Soumettre votre requète
4. Sauvegrader le fichier résultat avec un nom explicite
   
• Sous Unix :
1. Avec votre éditeur favori ou la commande sed,
   
changer dans le fichier sauvegardé "# -b" en "-1E+34 -1E+34".
2. Avec l'éditeur vi, cela donne :
   
:1,%s/#  -b/-1E+34 -1E+34/g
3. Avec la commande sed, cela donne :
   
sed -e "s/# -b/-1E+34 -1E+34/g" filename.dat > newfilename.dat
4. Noter le nombre de lignes avec la commande
   
wc -l newfilename.dat

• Sous Ferret :
yes? def axis/z=1:numberoflines:1 vector_length
yes? def grid/z=vector_length vector_grid
yes? file/var=cont_lon,cont_lat/g=vector_grid newfilename.dat
yes? plot/vs/line cont_lon,cont_lat


Recommencer l'opération pour ajouter les rivières, les frontières si besoin.

• Comment convertir du PDF en EPS ?
Voir la commande pdftops et notamment l'option -eps (http://www.foolabs.com/xpdf/download.html)
pdftops -eps -f 3 -l 3 file.pdf figure.eps

• Quel est l'espace nécessaire pour les programmes ferretloop, atlas, pdf2pdf, plt2pdf ?
Attention à bien exécuter ferretloop dans un répertoire où vous avez de la place.
La création d'un fichier pdf peut facilement demander plus de 50Mo d'espace disque.

• Comment configurer votre navigateur Netscape pour ouvrir directement des fichiers pdf ?
Vérifier que l'application acroread est accessible.
Pour le navigateur Netscape par exemple, ouvrir le menu Edition/Préférences puis Navigator/Applications.
Editer ou créer la fiche correspondant au descriptif : "Portable Document Format"
et la compléter en suivant le modèle suivant :

Description : Portable Document Format
type MIME : application/pdf
Suffixes : pdf
Application : acroread %s > /dev/null

• Comment configurer votre navigateur Netscape pour ouvrir les fichiers gif directement avec xanim ?
Afin de mieux contrôler la vitesse de défilement des animations, vous pouvez
configurer votre navigateur Netscape pour associer directement les fichiers gif à l'application xanim.
De la même manière que précédement, vérifier que l'application xanim est accessible.
Pour le navigateur Netscape par exemple, ouvrir le menu Edition/Préférences puis Navigator/Applications.
Editer ou créer la fiche correspondant au descriptif : "GIF Image"
et la compléter en suivant le modèle suivant :

Description : GIF Image
type MIME : image/gif
Suffixes : gif
Application : xanim %s > /dev/null

• Comment contrôler le défilement d'une animation gif avec xanim ?
Voir l'aide donnée par xanim -h pour une explication détaillée.
En résumé, en placant la souris sur la fenêtre de contrôle ou sur l'image
vous pouvez contrôler certains paramètres avec les touches du clavier :
<espace> pour arréter ou démarrer l'animation
<=> pour augmenter la vitesse d'animation
<-> pour diminuer la vitesse d'animation
<;> ou </>pour afficher l'image suivante de l'animation
<,> ou <m> pour afficher l'image précédente de l'animation

Vous pouvez aussi contrôler certains de ces paramètres avec les
boutons de la souris :
<gauche> pour afficher l'image précédente de l'animation
<milieu> pour arréter ou démarrer l'animation
<droit> pour afficher l'image suivante de l'animation
Essayer ces contrôles sur l'animation suivante.

• Quelles sont les alternatives à l'usage du programme xanim ?
Attention, le programme xanim provoque parfois avec une séquence d'images gif
comportant plusieurs palettes des "ratés" au niveau des couleurs.
Utiliser alors le programme animate ou bien netscape (qui n'a pas de possiblité
de contrôle de la vitesse d'animation, arrêt par ESC, reprise par Reload).

• Comment faire un peu de ménage automatiquement dans mes répertoires ?
Vous pouvez définir ou vous inspirer de l'alias suivant à placer dans le fichier
.cshrc si vous êtes en csh, tcsh ou dans le fichier .profile si vous êtes en ksh, bash.
En csh :
alias clean 'find . \( -name ".*%" -o -name "*%" -o -name "*~" -o -name "core*" -o -name "ferret.jnl*" -o -name "metafile*.plt*"  \) -print -exec rm {} \;'
En ksh :
alias clean='find . \( -name ".*%" -o -name "*%" -o -name "*~" -o -name "core*" -o -name "ferret.jnl*" -o -name "metafile*.plt*"  \) -print -exec rm {} \;'

• Comment utiliser pdf2pdf et où trouver la documentation sur le package pdfpages ?
Cette documentation est distribuée dans le package FAST.
Taper : acroread $FER_FAST/pdfpages.pdf (pdfpages.pdf).
Vous pourrez utiliser les options de ce package à travers le programme
pdf2pdf en spécifiant l'option -p ou --package.
L'usage est disponible en tapant : pdf2pdf -h (Voir l'aide en ligne : pdf2pdf -h).
Par exemple :

• pdf2pdf --output mydocument `ls -rt */*.pdf` produit le document pdf suivant.
  
C'est l'utilisation par défaut qui correspond aux options suivantes :
landscape=false,angle=90,nup=1x2,frame,link,linkfit=fitv
Les documents pdf sont assemblés sur une page en mode portrait, répartis sur
1 colonne et 2 lignes, après avoir appliqué une rotation de 90 degrés dans le sens
anti-horaire (trigonométrique).
Les caractères spéciaux ` (accent grave ou back-quote) sont utilisés ici
pour lister les documents pdf dans un ordre temporel croissant.

• pdf2pdf --landscape --output mydocument `ls -rt */*.pdf` produit le document pdf suivant.
  
Puisque les documents pdf à assembler sont initialement avec une orientation portrait,
il est intéressant d'utiliser l'option landscape.

• pdf2pdf --output mydocument --package landscape=false,angle=0,nup=2x2,frame,link,linkfit=fitv `ls -rt */*.pdf`
  
produit le document pdf suivant. Les options spécifiées indiquent un assemblage en mode portrait,
répartis en 2 colonnes et 2 lignes, sans rotation.

• Comment utiliser index2html ?
Vous pouvez créer un index hypertexte utilisable avec un navigateur en utilisant le
programme index2html.
L'usage est disponible en tapant : index2html -h (Voir l'aide en ligne : indexhtml -h).
Par exemple : indexhtml  --output mylinks `ls -rt */*.gif */*.pdf *.pdf`
Des liens sont crées pour tous les fichiers gif et pdf des sous-répertoires, ainsi que les fichiers
pdf du répertoire courant. Les caractères spéciaux ` (accent grave ou back-quote) sont utilisés ici
pour lister les documents pdf et gif dans un ordre temporel croissant.

• Pourquoi avoir utiliser le format PDF ?
Le format Adobe® Portable Document Format (PDF) est le format le plus courant pour le
partage de documents électroniques sur internet. C'est un language de description de page qui
permet de stocker des textes et figures de façon vectorielle et donc indépendantement du support.
En plus d'être un format plus compact que le format postscript, il permet une navigation
hypertext notamment via des onglets ou des liens tout en conservant l'apparence du
document papier.
Pour lire des documents PDF, les utilitaires les plus couramment utilisés sont les outils
d'Adobe comme Acrobat® Reader®.
Un inconvénient : l'impression directe d'un document PDF sur une imprimante postscript
n'est pas possible.  Lorsque vous imprimez un document PDF, le document est d'abord
traduit en postscript puis envoyé à l'imprimante.

• Pourquoi avoir utiliser le format GIF ?
Même si le format GIF n'est pas complétement libre puisqu'il utilise un
format de compression LZW proprietaire de Unisys Corporation, il demeure
un format répandu et facile d'usage grâce aux nombreux utilitaires disponibles
(xanim, netscape, display, xv...).
Mais c'est la possibilité d'assembler facilement plusieurs images et de
composer ainsi des séquences animées qui reste un atout majeur de ce format.
Ces séquence sont lisibles directement par les navigateurs ou bien avec des utilitaires
qui permettent un contrôle de la vitesse de défilement (xanim, animate).

• Comment créer une séquence animée au format GIF à partir d'images GIF ?
Vous pourrez utiliser la commande convert distribuée dans le package
ImageMagick (http://www.imagemagick.org/) pour assembler les images
gif et former des animations.
Un exemple utilisé lors de la génération des atlas :
convert -delay 50 -loop 0 file1.gif file2.gif animation.gif
Noter la présence de l'option -loop 0 qui permet un bouclage infini et l'utilisation
de l'option -delay 50 afin d'indiquer un délai de 50 centièmes de seconde entre
chaque image.

• Comment déposer diffuser vos résultats avec les serveur WEB/DODS de l'IPSL ?
Vous disposez de 450 Go d'espace disque pour diffuser vos résultats.
Un contrôle d'accès à vos répertoires est possible. Pour en savoir plus, consulter la
page suivante.

• Comment combiner des fichiers de configuration ligne à ligne ?
Vous pouvez utiliser la commande paste :
paste -d \\n fichier1 fichier2 > fichier_combiné
puis enlever les quelques lignes redondantes.

• Comment rajouter des pages d'entête à un atlas au format pdf ?
Vous avez la possiblité de rajouter des pages d'entête à un atlas au format pdf
en utilisant pdflatex et en suivant les étapes suivantes :

1. Constituer avec latex votre document pdf à insérer en entête de votre atlas.
   
C'est là par exemple que vous pourrez décrire votre simulation.
Vous pouvez vous inspirer du document latex suivant (entete.tex)
qui donne au format pdf le résultat suivant (entete.pdf) en utilisant
la commande : pdflatex entete.tex

2. Modifier le fichier latex résultat de votre commande atlas en
   
insérant les lignes suivantes :
\includepdfmerge[landscape=true,nup=1x2,frame,link,linkfit=fitv]
{
entete.pdf,-
}
Les options de la commande includepdfmerge concernant l'inclusion
du fichier d'entête seront indiquées comme identiques à celles qui concernent
l'inclusion des différentes parties de l'atlas.
Exemple : fichier original orca.tex transformé en orca_entete.tex

3. Générer le nouvel atlas incluant le fichier d'entête avec la commande
   
pdflatex nouvel_atlas.tex
Exemple : fichier pdf original orca.pdf (4280 Ko) transformé
en orca_entete.pdf (4324 Ko)

• Présentation sur une utilisation du XML à travers CDMS
Journée "XML" du 6 Décembre 2002 à l'IPSL
 
• Présentation sur FAST-ATLAS : un outils de diagnostics
Journée "Couplé" du 13 Décembre 2002 à l'IPSL
 
• Présentation sur les Perspectives des outils de diagnostics
Réunion interne LSCE - Thème 2 - Cycles BioGéoChimiques du 20 Janvier 2003 au LSCE


• Présentation sur DODS à L'IPSL
  Réunion technique IPSL du 24 janvier 2003
  
  
• Support de cours : formation outils pôle de modélisation (v102)
  Journée formation sur les outils du pôle de modélisation du climat de l'IPSL du 24 Avril 2003

• Si vous souhaitez être tenu au courant des évolutions futures de Ferret,
  des changements qui pourraient intervenir dans les bibliothèques FAST et ATLAS,
  vous pouvez vous inscrire sur la page suivante à partir des pages "wiki" de l'IPSL ,
  ou bien m'envoyer un mail (Patrick.Brockmann at cea.fr)